3P273 CoLBA : Comparative ligand binding analysis
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
مطالعه شیمی فیزیکی ساختمان لیزوزیم به روش ligand binding
پروتئینها فراوان تری مولکولهای آلی در بدن جانداران می باشند. آنزیم ها یکی از مهمترین نوع پروتئینهای کروی می باشند که بعضی از فعالیتهای حیات بدانها وابسته است . لیزوزیم اولین آنزیم شناخته شده است . این آنزیم دارای 129 واحد اسید آمینه در زنجیر پلی پپتیدی و چهار پیوند سیستئین درون زنجیری می باشد. لیزوزیم به دلیل دارا بودن اسید آمینه های باردار توان پذیرش بعضی از لیگاندها را دارا می باشد. در این پا...
15 صفحه اول[Receptor-ligand docking simulation for membrane proteins].
Protein structure-based molecular design using the computational techniques of protein structure prediction, ligand docking, and virtual screening is an integral part of drug discovery for limiting the application of the structure-based approach to target proteins such as G-protein-coupled receptors (GPCRs). GPCRs play an important role in living organisms and are of major interest to the pharm...
متن کاملAnalysis of ligand binding process using binding capacity concept.
Binding capacity is the homotropic second derivative of the binding potential with respect to the chemical potential of the ligand. It provides a measure of steepness of the binding isotherm and represents the extent of cooperativity. In the present study, the shape of the binding capacity curve for various systems was investigated and the relation between binding capacity and the extent of coo...
متن کاملPrediction of drug binding affinities by comparative binding energy analysis.
A new computational method for deducing quantitative structure-activity relationships (QSARs) using structural data from ligand-macromolecule complexes is presented. First, the ligand-macromolecule interaction energy is computed for a set of ligands using molecular mechanics calculations. Then, by selecting and scaling components of the ligand-macromolecule interaction energy that show good pre...
متن کاملLigand Binding: Molecular Mechanics
The force required to rupture the streptavidin-biotin complex was calculated here by computer simulations. The computed force agrees well with that obtained by recent single molecule atomic force microscope experiments. These simulations suggest a detailed multiple-pathway rupture mechanism involving five major unbinding steps. Binding forces and specificity are attributed to a hydrogen bond ne...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Seibutsu Butsuri
سال: 2004
ISSN: 0582-4052,1347-4219
DOI: 10.2142/biophys.44.s258_1